Училась на педагогических курсах, на историко-филологическом факультете.
Работу в кино начала в 1924. В течение многих лет была сценаристом-консультантом, редактором и заведующим сценарным отделом на киностудии «Межрабпомфильм», а затем на киностудии «Союздетфильм».
В связи с 20-летием первой русской революции юбилейная комиссия ВЦИКа утвердила сценарий Агаджановой «1905 год». В этом сценарии восстание на броненосце «Потёмкин» было одним из эпизодов фильма.
По предложению Агаджановой для постановки фильма «1905 год» был привлечён С. Эйзенштейн. В процессе работы эпизод о «Потёмкине» вырос в самостоятельный сценарий, по которому в 1925 Эйзенштейн поставил фильм «Броненосец «Потёмкин».
В создании фильма «Два-Бульди-два» принимала участие как режиссёр.